分类

酿酒酵母感受态细胞

● 文库化转感受态
NMY51 Chemically-Library Competent Cell

产品规格(CAT#: YCL1040)

NMY51 Chemically-Library Competent Cell:             600μl/支              保存: -80℃(3个月)

pGADT7 (control vector, 10 ng/μl)                                10μl                 保存:-80℃(12个月)

Carrier DNA (10 μg/μl)                                              300μl/1.2ml         保存:4℃(12个月)

PEG/LiAC:                                                                   15ml/60ml          保存:    4℃(12个月)

产品名称
产品货号
产品规格
产品配套 说明书下载
NMY51  文库化转感受态细胞
YCL1040S 5×600ul

Carrier DNA 300ul×1

PEG/LiAC 15ml×1


YCL1040M 20×600ul

Carrier DNA 1.2ml×1

PEG/LiAC 60ml×1


基因型

MATa, his3Δ200, trp1-901, leu2-3, 112, ade2, LYS2::(lexAop)4-HIS3, ura3::(lexAop)8-lacZ, ade2::(lexAop) 8-ADE2, GAL4


产品说明

DUAL membrane系统是DUAL systems BioTech公司开发的专门筛选跨膜蛋白间相互作用的检测技术,它利用分离的泛素系统 (split-ubiquitin)直接检测天然状态下膜蛋白间的相互作用,是目前市面上唯一检测膜蛋白间相互作用的酵母双杂系统。此系统采用NMY51酵母菌株,可直接转化质粒进行蛋白互作验证或筛库试验;此菌株Transformation marker为:trp1,leu2-3,报告基因为:HIS3,ADE2和 lacZ,第一步通过营养缺陷型报告基因 (HIS3,ADE2)进行选择性生长筛选,进一步通过 LacZ报告基因进行β-半乳糖分析显色的定量或半定量筛选,三个独立的报告基因,受不同启动子的调控,降低假阳性几率。原理:泛素 (ubiquitin)分子量很小,由 76 aa残基组成;泛素作为降解信号分子,可以连接另外一种蛋白质的 N端,然后被泛素专一性蛋白酶 (UBPs)识别,从而导致与泛素相连的蛋白被酶解。泛素可以人为分成两部分:N端 (Nub),C端 (Cub)。首先,人为地将泛素 Nub的 3位异亮氨酸突变为甘氨酸 (NubI 突变为 NubG)。这样与 Cub的亲合力大大降低,避免了 Cub和 Nub自我结合或接近的可能性。其次,将Cub部分与人工合成的 LexA-VP16转录激活因子融合成一个融合蛋白Cub-LexA-VP16。正常条件下 NubG不与Cub 结合,UBPs也不能识别分离的泛素,转录激活因子也不会被切下来。最后,将要检测的蛋白质分别与NubG和Cub融合,形成 bait融合蛋 (bait-cub-LexA-VP16)和 prey融合蛋白 (prey-NubG)。如果 bait和 prey发生相互作用,就会促使 NubG和 Cub的相互接近,被 UBPs识别,导致 LexA-VP16的解离,进入核内,从而激活报告基因的转录。 此系统可使用四种Bait质粒:pBT3-N,pBT3-SUC,pBT3-STE,pBT3-C,筛选标志均为LEU;三种Prey质粒:pPR3-C ,pPR3-SUC,pPR3-STE,筛选标志均为TRP。NMY51 Chemically-Library Competent Cell为构建酵母文库用化转感受态,经特殊工艺制作,-80℃可保存三个月,pGADT7质粒(7988bp,AmpR)检测转化效率>0.5×106 cfu/μg DNA。


操作方法

1. Carrier DNA 的预处理:将Carrier DNA 插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

2. 取600 µl冰上融化的Y2HGold感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-15 µg(加入DNA的体积不超过50µl,DNA纯度越高越好),预处理的Carrier DNA 60 µl,PEG/LiAc 1ml,吸打几次混匀,转移到事先准备好的10ml圆底离心管中,补加PEG/LiAc 2ml,混匀,30℃水浴60 min (30 min时翻转6-8次混匀)。

3. 将管放42℃水浴20 min (10 min时翻转6-8次混匀)。

4. 5000 rpm离心 2 min弃上清,ddH2O 10ml重悬,离心2min弃上清,ddH2O 1-10ml重悬,涂板,29℃培养48-96 h。

5. 为提高转化效率也可5000 rpm离心 2 min弃上清后加入3ml YPD Plus(唯地CAT#:YC6006)重悬,30℃,200rpm摇菌1.5h。离心2min弃上清,加入1-10ml 0.9%的氯化钠重悬涂板。


培养基配制

① YPDA (1L) (唯地CAT#:YM1020):

     Tryptone                          20g

     Yeast extract                    10g

     0.2% adenine                  15ml

     补水到 950ml,用盐酸调PH到6.5;

     Agar          20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌;

     待培养基温度降到55℃时,加入已过滤的40% 葡萄糖 50 ml。


③ 0.2% adenine (1L) (唯地CAT#:YC6030)

  Adenine    2g; 补水到1L;溶解后高压灭菌或0.22µm 滤膜过滤除菌。


② SD medium (1L)(唯地CAT#:YM3101-YM3611):

     Yeast Nitrogen base                    6.7g

     葡萄糖                                           20g

     Dropout                    适量(按说明书)

     补水到1L,调PH至5.8;

     Agar                     20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌。


注意事项 

1. 感受态细胞最好在冰上融化,加入质粒DNA的体积不超过50ul,文库质粒纯度越高越好。

2. 文库用酵母感受态的转化效率数据是在加入不超过100ng标准质粒的试验中获得,若加入质粒过多,虽然得到的菌落数会增加,但由此计算的转化效率会下降。

3. NMY51酵母菌株对高温敏感,最适生长温度为27-30℃;高于31℃,生长速度和转化效率下降。

4. 菌落变粉不是污染,是酵母细胞生长中一个常见现象。当细胞在平板培养几天后,平板上的Adenine被酵母消耗完毕,酵母试图通过自身代谢途径合成Adenine以供利用,然而,有些菌株的ADE2基因被破坏,Adenine合成途径受阻;又由于其ADE4,5,6,7,8基因均正常,所以造成中间产物P-ribosylamino imidazole (AIR) 在细胞中积累而使菌落变为粉红色。

5. 酵母在缺陷培养基中生长速度比YPDA培养基慢,培养基中缺陷成分越多,生长越慢。以转化涂板为例:涂YPDA平板29℃,48 h培养可见直径1 mm克隆;涂SD单缺平板29℃,48-60 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD双缺平板29℃,60-80 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD三缺或四缺平板平板29℃,80-90h培养可见直径1 mm克隆。

产品名称
产品货号
产品规格
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NMY51  文库化转感受态细胞
YCL1040S 5×600ul

Carrier DNA 300ul×1

PEG/LiAC 15ml×1


YCL1040M 20×600ul

Carrier DNA 1.2ml×1

PEG/LiAC 60ml×1


基因型

MATa, his3Δ200, trp1-901, leu2-3, 112, ade2, LYS2::(lexAop)4-HIS3, ura3::(lexAop)8-lacZ, ade2::(lexAop) 8-ADE2, GAL4


产品说明

DUAL membrane系统是DUAL systems BioTech公司开发的专门筛选跨膜蛋白间相互作用的检测技术,它利用分离的泛素系统 (split-ubiquitin)直接检测天然状态下膜蛋白间的相互作用,是目前市面上唯一检测膜蛋白间相互作用的酵母双杂系统。此系统采用NMY51酵母菌株,可直接转化质粒进行蛋白互作验证或筛库试验;此菌株Transformation marker为:trp1,leu2-3,报告基因为:HIS3,ADE2和 lacZ,第一步通过营养缺陷型报告基因 (HIS3,ADE2)进行选择性生长筛选,进一步通过 LacZ报告基因进行β-半乳糖分析显色的定量或半定量筛选,三个独立的报告基因,受不同启动子的调控,降低假阳性几率。原理:泛素 (ubiquitin)分子量很小,由 76 aa残基组成;泛素作为降解信号分子,可以连接另外一种蛋白质的 N端,然后被泛素专一性蛋白酶 (UBPs)识别,从而导致与泛素相连的蛋白被酶解。泛素可以人为分成两部分:N端 (Nub),C端 (Cub)。首先,人为地将泛素 Nub的 3位异亮氨酸突变为甘氨酸 (NubI 突变为 NubG)。这样与 Cub的亲合力大大降低,避免了 Cub和 Nub自我结合或接近的可能性。其次,将Cub部分与人工合成的 LexA-VP16转录激活因子融合成一个融合蛋白Cub-LexA-VP16。正常条件下 NubG不与Cub 结合,UBPs也不能识别分离的泛素,转录激活因子也不会被切下来。最后,将要检测的蛋白质分别与NubG和Cub融合,形成 bait融合蛋 (bait-cub-LexA-VP16)和 prey融合蛋白 (prey-NubG)。如果 bait和 prey发生相互作用,就会促使 NubG和 Cub的相互接近,被 UBPs识别,导致 LexA-VP16的解离,进入核内,从而激活报告基因的转录。 此系统可使用四种Bait质粒:pBT3-N,pBT3-SUC,pBT3-STE,pBT3-C,筛选标志均为LEU;三种Prey质粒:pPR3-C ,pPR3-SUC,pPR3-STE,筛选标志均为TRP。NMY51 Chemically-Library Competent Cell为构建酵母文库用化转感受态,经特殊工艺制作,-80℃可保存三个月,pGADT7质粒(7988bp,AmpR)检测转化效率>0.5×106 cfu/μg DNA。


操作方法

1. Carrier DNA 的预处理:将Carrier DNA 插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

2. 取600 µl冰上融化的Y2HGold感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-15 µg(加入DNA的体积不超过50µl,DNA纯度越高越好),预处理的Carrier DNA 60 µl,PEG/LiAc 1ml,吸打几次混匀,转移到事先准备好的10ml圆底离心管中,补加PEG/LiAc 2ml,混匀,30℃水浴60 min (30 min时翻转6-8次混匀)。

3. 将管放42℃水浴20 min (10 min时翻转6-8次混匀)。

4. 5000 rpm离心 2 min弃上清,ddH2O 10ml重悬,离心2min弃上清,ddH2O 1-10ml重悬,涂板,29℃培养48-96 h。

5. 为提高转化效率也可5000 rpm离心 2 min弃上清后加入3ml YPD Plus(唯地CAT#:YC6006)重悬,30℃,200rpm摇菌1.5h。离心2min弃上清,加入1-10ml 0.9%的氯化钠重悬涂板。


培养基配制

① YPDA (1L) (唯地CAT#:YM1020):

     Tryptone                          20g

     Yeast extract                    10g

     0.2% adenine                  15ml

     补水到 950ml,用盐酸调PH到6.5;

     Agar          20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌;

     待培养基温度降到55℃时,加入已过滤的40% 葡萄糖 50 ml。


③ 0.2% adenine (1L) (唯地CAT#:YC6030)

  Adenine    2g; 补水到1L;溶解后高压灭菌或0.22µm 滤膜过滤除菌。


② SD medium (1L)(唯地CAT#:YM3101-YM3611):

     Yeast Nitrogen base                    6.7g

     葡萄糖                                           20g

     Dropout                    适量(按说明书)

     补水到1L,调PH至5.8;

     Agar                     20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌。


注意事项 

1. 感受态细胞最好在冰上融化,加入质粒DNA的体积不超过50ul,文库质粒纯度越高越好。

2. 文库用酵母感受态的转化效率数据是在加入不超过100ng标准质粒的试验中获得,若加入质粒过多,虽然得到的菌落数会增加,但由此计算的转化效率会下降。

3. NMY51酵母菌株对高温敏感,最适生长温度为27-30℃;高于31℃,生长速度和转化效率下降。

4. 菌落变粉不是污染,是酵母细胞生长中一个常见现象。当细胞在平板培养几天后,平板上的Adenine被酵母消耗完毕,酵母试图通过自身代谢途径合成Adenine以供利用,然而,有些菌株的ADE2基因被破坏,Adenine合成途径受阻;又由于其ADE4,5,6,7,8基因均正常,所以造成中间产物P-ribosylamino imidazole (AIR) 在细胞中积累而使菌落变为粉红色。

5. 酵母在缺陷培养基中生长速度比YPDA培养基慢,培养基中缺陷成分越多,生长越慢。以转化涂板为例:涂YPDA平板29℃,48 h培养可见直径1 mm克隆;涂SD单缺平板29℃,48-60 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD双缺平板29℃,60-80 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD三缺或四缺平板平板29℃,80-90h培养可见直径1 mm克隆。