分类

酿酒酵母感受态细胞

● 文库化转感受态
Y187 Chemically-Library Competent Cell

产品规格(CAT#: YCL1020)

Y187 Chemically-Library Competent Cell:              600μl/支              保存: -80℃(3个月)

pGADT7 (control vector, 10 ng/μl)                                10μl              保存:-80℃(12个月)

Carrier DNA (10 μg/μl)                                      300μl/1.2ml              保存:-20℃(12个月)

PEG/LiAC:                                                            15ml/60ml              保存:    4℃(12个月)

产品名称
产品货号
产品规格
产品配套 说明书下载
Y187  文库化转感受态细胞
YCL1020S 5×600ul

Carrier DNA 300ul×1

PEG/LiAC 15ml×1


YCL1020M 20×600ul

Carrier DNA 1.2ml×1

PEG/LiAC 60ml×1


基因型

MATα, ura3-52, his3-200, ade 2-101, trp 1-901, leu 2-3, 112, gal4Δ, met-, gal80Δ, URA3::GAL1UAS-GAL1TATA-lacZ, MEL1


产品说明

Y187菌株是Clontech公司开发的GAL4系统酵母单杂,双杂实验用菌株,MATα型,可直接转化质粒或与MATa型酵母菌株 (Y2HGold,AH109等)通过mating操作进行筛库试验。Transformation marker为: trp1, leu2,报告基因为:lacZ,MEL1。Y187-GAL4酵母双杂系统需要两种质粒配套使用:pGBKT7和pGADT7。质粒pGBKT7的筛选标志为TRP1,用于表达DNA-BD (来自酵母转录因子GAL4N端1~174位氨基酸)与目标蛋白 (Bait)的融合蛋白;质粒pGADT7的筛选标志为LEU,用于表达AD (GAL4 C端768~881位氨基酸)与目标蛋白 (Prey)的融合蛋白。GAL4系统原理:一个完整的酵母转录因子GAL4可分为功能上相互独立的两个结构域:位于N端1~174位氨基酸区段的DNA结合域 (DNA-BD)和位于C端768~881位氨基酸区段的转录激活域 (AD)。DNA-BD能够识别GAL4-responsive gene的上游激活序列UAS,并与之结合。而AD可以启动UAS下游的基因进行转录。BD和AD单独存在不能激活转录,但当二者接近时,则呈现完整的GAL4活性,使含有UAS的启动子下游基因转录表达。正常条件下,BD不与AD结合,将要检测的蛋白质分别与BD和AD融合,形成 bait融合蛋白 (bait –BD)和 prey融合蛋白 (prey-AD),如果 bait和 prey发生相互作用,就会促使 BD和 AD的相互接近,形成完整的GAL4,从而激活报告基因的转录。Y187有两个报告基因:lacZ,MEL1,分别由两种不同的启动子 (G1,M1)启动,这两种启动子只有GAL4识别的17 bp核心区相同,其余部分均不同,大大降低了酵母双杂假阳性发生的概率。Y187 Chemically-Library Competent Cell为构建酵母文库用化转感受态,经特殊工艺制作,-80℃可保存三个月,pGADT7质粒(7988bp,AmpR)检测转化效率>0.5×106 cfu/μg DNA。


操作方法

1. Carrier DNA 的预处理:将Carrier DNA 插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

2. 取600 µl冰上融化的Y187感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-15 µg(加入DNA的体积不超过50ul,DNA纯度越高越好),预处理的Carrier DNA 60 µl,PEG/LiAc 1ml,吸打几次混匀,转移到事先准备好的10ml圆底离心管中,补加PEG/LiAc 2ml,混匀,30℃水浴60 min (30 min时翻转6-8次混匀)。

3. 将管放42℃水浴20 min (10 min时翻转6-8次混匀)。

4. 5000 rpm离心 2 min弃上清,ddH2O 10ml重悬,离心2min弃上清,ddH2O 1-10ml重悬,涂板,29℃培养48-96 h。

5. 为提高转化效率也可5000 rpm离心 2 min弃上清后加入3ml YPD Plus重悬,30℃,200rpm摇菌1.5h。离心2min弃上清,加入1-10ml 0.9%的氯化钠重悬涂板。


培养基配制

① YPDA (1L) (唯地CAT#:YM1020):

     Tryptone                          20g

     Yeast extract                    10g

     0.2% adenine                  15ml

     补水到 950ml,用盐酸调PH到6.5;

     Agar          20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌;

     待培养基温度降到55℃时,加入已过滤的40% 葡萄糖 50 ml。


③ 0.2% adenine (0.5L) (唯地CAT#:YC6030)

  Adenine    1g; 补水到0.5L;溶解后高压灭菌或0.22µm 滤膜过滤除菌。


② SD medium (1L)(唯地CAT#:YM3101-YM3611):

     Yeast Nitrogen base                    6.7g

     葡萄糖                                           20g

     Dropout                    适量(按说明书)

     补水到1L,调PH至5.8;

     Agar                     20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌。


注意事项

1. 感受态细胞最好在冰上融化,加入质粒DNA的体积不超过50ul,文库质粒纯度越高越好。

2. 文库用酵母感受态的转化效率数据是在加入不超过100ng标准质粒的试验中获得,若加入质粒过多,虽然得到的菌落数会增加,但由此计算的转化效率会下降。

3. Y187酵母菌株对高温敏感,最适生长温度为27-30℃;高于31℃,生长速度和转化效率下降。

4. 菌落变粉不是污染,是酵母细胞生长中一个常见现象。当细胞在平板培养几天后,平板上的Adenine被酵母消耗完毕,酵母试图通过自身代谢途径合成Adenine以供利用,然而,有些菌株的ADE2基因被破坏,Adenine合成途径受阻;又由于其ADE4,5,6,7,8基因均正常,所以造成中间产物P-ribosylamino imidazole (AIR) 在细胞中积累而使菌落变为粉红色。

5. 酵母在缺陷培养基中生长速度比YPDA培养基慢,培养基中缺陷成分越多,生长越慢。以转化涂板为例:涂YPDA平板29℃,48 h培养可见直径1 mm克隆;涂SD单缺平板29℃,48-60 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD双缺平板29℃,60-80 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD三缺或四缺平板平板29℃,80-90h培养可见直径1 mm克隆。

产品名称
产品货号
产品规格
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Y187  文库化转感受态细胞
YCL1020S 5×600ul

Carrier DNA 300ul×1

PEG/LiAC 15ml×1


YCL1020M 20×600ul

Carrier DNA 1.2ml×1

PEG/LiAC 60ml×1


基因型

MATα, ura3-52, his3-200, ade 2-101, trp 1-901, leu 2-3, 112, gal4Δ, met-, gal80Δ, URA3::GAL1UAS-GAL1TATA-lacZ, MEL1


产品说明

Y187菌株是Clontech公司开发的GAL4系统酵母单杂,双杂实验用菌株,MATα型,可直接转化质粒或与MATa型酵母菌株 (Y2HGold,AH109等)通过mating操作进行筛库试验。Transformation marker为: trp1, leu2,报告基因为:lacZ,MEL1。Y187-GAL4酵母双杂系统需要两种质粒配套使用:pGBKT7和pGADT7。质粒pGBKT7的筛选标志为TRP1,用于表达DNA-BD (来自酵母转录因子GAL4N端1~174位氨基酸)与目标蛋白 (Bait)的融合蛋白;质粒pGADT7的筛选标志为LEU,用于表达AD (GAL4 C端768~881位氨基酸)与目标蛋白 (Prey)的融合蛋白。GAL4系统原理:一个完整的酵母转录因子GAL4可分为功能上相互独立的两个结构域:位于N端1~174位氨基酸区段的DNA结合域 (DNA-BD)和位于C端768~881位氨基酸区段的转录激活域 (AD)。DNA-BD能够识别GAL4-responsive gene的上游激活序列UAS,并与之结合。而AD可以启动UAS下游的基因进行转录。BD和AD单独存在不能激活转录,但当二者接近时,则呈现完整的GAL4活性,使含有UAS的启动子下游基因转录表达。正常条件下,BD不与AD结合,将要检测的蛋白质分别与BD和AD融合,形成 bait融合蛋白 (bait –BD)和 prey融合蛋白 (prey-AD),如果 bait和 prey发生相互作用,就会促使 BD和 AD的相互接近,形成完整的GAL4,从而激活报告基因的转录。Y187有两个报告基因:lacZ,MEL1,分别由两种不同的启动子 (G1,M1)启动,这两种启动子只有GAL4识别的17 bp核心区相同,其余部分均不同,大大降低了酵母双杂假阳性发生的概率。Y187 Chemically-Library Competent Cell为构建酵母文库用化转感受态,经特殊工艺制作,-80℃可保存三个月,pGADT7质粒(7988bp,AmpR)检测转化效率>0.5×106 cfu/μg DNA。


操作方法

1. Carrier DNA 的预处理:将Carrier DNA 插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

2. 取600 µl冰上融化的Y187感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-15 µg(加入DNA的体积不超过50ul,DNA纯度越高越好),预处理的Carrier DNA 60 µl,PEG/LiAc 1ml,吸打几次混匀,转移到事先准备好的10ml圆底离心管中,补加PEG/LiAc 2ml,混匀,30℃水浴60 min (30 min时翻转6-8次混匀)。

3. 将管放42℃水浴20 min (10 min时翻转6-8次混匀)。

4. 5000 rpm离心 2 min弃上清,ddH2O 10ml重悬,离心2min弃上清,ddH2O 1-10ml重悬,涂板,29℃培养48-96 h。

5. 为提高转化效率也可5000 rpm离心 2 min弃上清后加入3ml YPD Plus重悬,30℃,200rpm摇菌1.5h。离心2min弃上清,加入1-10ml 0.9%的氯化钠重悬涂板。


培养基配制

① YPDA (1L) (唯地CAT#:YM1020):

     Tryptone                          20g

     Yeast extract                    10g

     0.2% adenine                  15ml

     补水到 950ml,用盐酸调PH到6.5;

     Agar          20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌;

     待培养基温度降到55℃时,加入已过滤的40% 葡萄糖 50 ml。


③ 0.2% adenine (0.5L) (唯地CAT#:YC6030)

  Adenine    1g; 补水到0.5L;溶解后高压灭菌或0.22µm 滤膜过滤除菌。


② SD medium (1L)(唯地CAT#:YM3101-YM3611):

     Yeast Nitrogen base                    6.7g

     葡萄糖                                           20g

     Dropout                    适量(按说明书)

     补水到1L,调PH至5.8;

     Agar                     20g(for plates only)

     121℃,15 min高压灭菌。


注意事项

1. 感受态细胞最好在冰上融化,加入质粒DNA的体积不超过50ul,文库质粒纯度越高越好。

2. 文库用酵母感受态的转化效率数据是在加入不超过100ng标准质粒的试验中获得,若加入质粒过多,虽然得到的菌落数会增加,但由此计算的转化效率会下降。

3. Y187酵母菌株对高温敏感,最适生长温度为27-30℃;高于31℃,生长速度和转化效率下降。

4. 菌落变粉不是污染,是酵母细胞生长中一个常见现象。当细胞在平板培养几天后,平板上的Adenine被酵母消耗完毕,酵母试图通过自身代谢途径合成Adenine以供利用,然而,有些菌株的ADE2基因被破坏,Adenine合成途径受阻;又由于其ADE4,5,6,7,8基因均正常,所以造成中间产物P-ribosylamino imidazole (AIR) 在细胞中积累而使菌落变为粉红色。

5. 酵母在缺陷培养基中生长速度比YPDA培养基慢,培养基中缺陷成分越多,生长越慢。以转化涂板为例:涂YPDA平板29℃,48 h培养可见直径1 mm克隆;涂SD单缺平板29℃,48-60 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD双缺平板29℃,60-80 h培养可见直径1 mm克隆,涂SD三缺或四缺平板平板29℃,80-90h培养可见直径1 mm克隆。