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克隆感受态细胞

● HB101(含pRK2013)二代甘油菌种
HB101(含pRK2013)二代甘油菌种

产品规格(CAT#: Beh1011)

HB101(含pRK2013) 二代甘油菌

400μl /1支
LB+Kan50ug/ml平板

9cm/ 2块

一次性接种环
4支


产品名称
产品货号
规格 说明书下载
HB101(含pRK2013) 二代甘油菌种
Beh1011
400ul/1支


产品说明

pRK2013 是通过重组DNA技术构建的合成质粒,来源于 pRK2 质粒,pRK2 提供全套高效接合转移所需的基因(tra 和 trb 等)。为了使该质粒能在常规大肠杆菌中方便操作,研究人员将来源于 ColE1 质粒的复制起始位点(ColE1 ori)和一段包含卡那霉素抗性基因(kanR)的 Tn903 转座子插入到 pRK2 骨架中,保留了完整的 RK2 质粒接合转移基因,能有效驱动其他质粒的转移。自1980年构建以来,在超过 2000 篇文献中使用。其宿主范围广泛,能将质粒转移至不动杆菌属、农杆菌属、芽孢杆菌属、假单胞菌属、根瘤菌属等多种革兰氏阴性菌,甚至部分革兰氏阳性菌中。


pRK2013工作原理:三亲本接合法 (Triparental Mating)

这是 pRK2013 最核心的应用场景。其工作原理涉及三种不同的细菌:

供体菌 (Donor):含有待转移的目标质粒(该质粒需带有 oriT 转移起始点)的大肠杆菌。

辅助菌 (Helper):含有 pRK2013 质粒的大肠杆菌。

受体菌 (Recipient):最终接收目标质粒的目的菌,如根癌农杆菌、根瘤菌、枯草芽孢杆菌、假单胞菌等。

作用机制:将三种细菌混合培养时,pRK2013 利用其编码的接合蛋白(Mob/Tra 蛋白),游动进入供体菌。在供体菌内,pRK2013 识别目标质粒上的 oriT 序列,并动员目标质粒进入受体菌。pRK2013 本身通常不会进入最终受体菌,从而避免了外源遗传元件的持续干扰(部分实验中,pRK2013 可以进入受体菌,但不能在许多非肠道革兰氏阴性菌中复制)。

核心用途:非自转移质粒的动员 (Mobilization of Non-self-transmissible Plasmids),作为最经典的帮助质粒(Helper Plasmid),pRK2013 的核心作用是辅助那些自身缺乏移动能力的质粒进行接合转移。在植物遗传转化、难转化芽孢杆菌或假单胞菌的质粒转化等实验中,它能通过三亲接合的方式,将目标质粒从大肠杆菌转移到根癌农杆菌、根瘤菌、枯草芽孢杆菌、假单胞菌等受体菌中。


附言:待转移的目标质粒必须带有一个特定的转移起始点(oriT),pRK2013 的游动和转移基因才能对其起作用,并驱动其转移进入受体菌;若质粒同时含有活化位点(bom),可促进质粒移动,部分受体菌不需要质粒含有bom序列。


操作方法

1,客户收到菌株后,不可直接吸取菌液接种扩繁。应先对菌种进行复壮,待长出单菌落后挑单菌落接菌扩繁;复壮方法如下:在超净台打开盖子,用接种环沾取少量甘油菌液采用交叉划线法(图1)在LB+Kan50ug/ml平板表面轻轻划线(注意:不要刺破培养基),将平板封口后放37度培养15-20h,即可长出单菌落。

2,交叉划线法:划线的目的是经过几次不连续划线达到梯度稀释菌液的效果,保证能长出单菌落。具体步骤如下:

A,-80度取出的甘油菌应在超净台打开盖子,立即在表面挑取菌液/菌块划线,不用等融化后划线,固体状态时即可用接种环挑取划线,操作要点是“快速操作,立即划线”,目的是最大限度减少温度波动对菌种造成的“冷休克”和冰晶物理损伤;如果收到的是液体甘油菌,可直接划线,在超净台打开盖子用接种环沾取少量甘油菌液划线。

B,取出无菌接种环,注意不要污染,图1所示为标准的五段交叉划线法,分五个区,每个区划三条直线,第1、2区可共用一个接种环,划好1,2区后换一个新接种环划第3区,再换一个新接种环划第4区,再换一个新接种环划第5区,每一次换接种环划线要经过前面划线区的划线痕迹,这样就相当于对菌种进行稀释。简易划线也可只划3个区或4个区。          

C,客户也可用金属接种环灼烧后划线;本公司提供的接种环为ABS材质,不可灼烧。  

图1. 五段交叉划线法示意图


注意事项

1,客户收到二代甘油菌株后,应立即放-80度保存,不可放-20度保存。

2,应减少甘油菌冻融的次数,冻融的次数越多,菌种的活力越低;

3,若扩繁菌种,注意一次扩繁不要超过四个世代,以保证菌种基因组的稳定;扩增后重新保存的菌种必须对菌种做表型、功能验证,所有表型、功能保持完好的菌株才能作为菌种使用。


相关文献

Hall, A., Donohue, T. J., & Peters, J. M. (2023). Complete sequences of conjugal helper plasmids pRK2013 and pEVS104. microPublication Biology, 2023. Available at: https://www.osti.gov/biblio/2202406.

Ditta, G., Stanfield, S., Corbin, D., & Helinski, D. R. (1980). Broad host range DNA cloning system for gram-negative bacteria: construction of a gene bank of Rhizobium meliloti. Proceedings of the National Academy of Sciences, 77(12), 7347-7351.Figurski, D. H., & Helinski, D. R. (1979). Replication of an origin-containing derivative of plasmid RK2 dependent on a plasmid function provided in trans. Proceedings of the National Academy of Sciences, 76(4), 1648-1652.



产品名称
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HB101(含pRK2013) 二代甘油菌种
Beh1011
400ul/1支


产品说明

pRK2013 是通过重组DNA技术构建的合成质粒,来源于 pRK2 质粒,pRK2 提供全套高效接合转移所需的基因(tra 和 trb 等)。为了使该质粒能在常规大肠杆菌中方便操作,研究人员将来源于 ColE1 质粒的复制起始位点(ColE1 ori)和一段包含卡那霉素抗性基因(kanR)的 Tn903 转座子插入到 pRK2 骨架中,保留了完整的 RK2 质粒接合转移基因,能有效驱动其他质粒的转移。自1980年构建以来,在超过 2000 篇文献中使用。其宿主范围广泛,能将质粒转移至不动杆菌属、农杆菌属、芽孢杆菌属、假单胞菌属、根瘤菌属等多种革兰氏阴性菌,甚至部分革兰氏阳性菌中。


pRK2013工作原理:三亲本接合法 (Triparental Mating)

这是 pRK2013 最核心的应用场景。其工作原理涉及三种不同的细菌:

供体菌 (Donor):含有待转移的目标质粒(该质粒需带有 oriT 转移起始点)的大肠杆菌。

辅助菌 (Helper):含有 pRK2013 质粒的大肠杆菌。

受体菌 (Recipient):最终接收目标质粒的目的菌,如根癌农杆菌、根瘤菌、枯草芽孢杆菌、假单胞菌等。

作用机制:将三种细菌混合培养时,pRK2013 利用其编码的接合蛋白(Mob/Tra 蛋白),游动进入供体菌。在供体菌内,pRK2013 识别目标质粒上的 oriT 序列,并动员目标质粒进入受体菌。pRK2013 本身通常不会进入最终受体菌,从而避免了外源遗传元件的持续干扰(部分实验中,pRK2013 可以进入受体菌,但不能在许多非肠道革兰氏阴性菌中复制)。

核心用途:非自转移质粒的动员 (Mobilization of Non-self-transmissible Plasmids),作为最经典的帮助质粒(Helper Plasmid),pRK2013 的核心作用是辅助那些自身缺乏移动能力的质粒进行接合转移。在植物遗传转化、难转化芽孢杆菌或假单胞菌的质粒转化等实验中,它能通过三亲接合的方式,将目标质粒从大肠杆菌转移到根癌农杆菌、根瘤菌、枯草芽孢杆菌、假单胞菌等受体菌中。


附言:待转移的目标质粒必须带有一个特定的转移起始点(oriT),pRK2013 的游动和转移基因才能对其起作用,并驱动其转移进入受体菌;若质粒同时含有活化位点(bom),可促进质粒移动,部分受体菌不需要质粒含有bom序列。


操作方法

1,客户收到菌株后,不可直接吸取菌液接种扩繁。应先对菌种进行复壮,待长出单菌落后挑单菌落接菌扩繁;复壮方法如下:在超净台打开盖子,用接种环沾取少量甘油菌液采用交叉划线法(图1)在LB+Kan50ug/ml平板表面轻轻划线(注意:不要刺破培养基),将平板封口后放37度培养15-20h,即可长出单菌落。

2,交叉划线法:划线的目的是经过几次不连续划线达到梯度稀释菌液的效果,保证能长出单菌落。具体步骤如下:

A,-80度取出的甘油菌应在超净台打开盖子,立即在表面挑取菌液/菌块划线,不用等融化后划线,固体状态时即可用接种环挑取划线,操作要点是“快速操作,立即划线”,目的是最大限度减少温度波动对菌种造成的“冷休克”和冰晶物理损伤;如果收到的是液体甘油菌,可直接划线,在超净台打开盖子用接种环沾取少量甘油菌液划线。

B,取出无菌接种环,注意不要污染,图1所示为标准的五段交叉划线法,分五个区,每个区划三条直线,第1、2区可共用一个接种环,划好1,2区后换一个新接种环划第3区,再换一个新接种环划第4区,再换一个新接种环划第5区,每一次换接种环划线要经过前面划线区的划线痕迹,这样就相当于对菌种进行稀释。简易划线也可只划3个区或4个区。          

C,客户也可用金属接种环灼烧后划线;本公司提供的接种环为ABS材质,不可灼烧。  

图1. 五段交叉划线法示意图


注意事项

1,客户收到二代甘油菌株后,应立即放-80度保存,不可放-20度保存。

2,应减少甘油菌冻融的次数,冻融的次数越多,菌种的活力越低;

3,若扩繁菌种,注意一次扩繁不要超过四个世代,以保证菌种基因组的稳定;扩增后重新保存的菌种必须对菌种做表型、功能验证,所有表型、功能保持完好的菌株才能作为菌种使用。


相关文献

Hall, A., Donohue, T. J., & Peters, J. M. (2023). Complete sequences of conjugal helper plasmids pRK2013 and pEVS104. microPublication Biology, 2023. Available at: https://www.osti.gov/biblio/2202406.

Ditta, G., Stanfield, S., Corbin, D., & Helinski, D. R. (1980). Broad host range DNA cloning system for gram-negative bacteria: construction of a gene bank of Rhizobium meliloti. Proceedings of the National Academy of Sciences, 77(12), 7347-7351.Figurski, D. H., & Helinski, D. R. (1979). Replication of an origin-containing derivative of plasmid RK2 dependent on a plasmid function provided in trans. Proceedings of the National Academy of Sciences, 76(4), 1648-1652.