分类

酿酒酵母感受态细胞

● 试剂盒
EBY.VW4000酵母己糖转运活性检测试剂盒

产品说明

     EBY.VW4000菌株来源于CEN.PK2-1C酵母菌株,MATa型,Transformation marker为ura3,可用于筛选标记为URA3的质粒的转化,比如pYES2/NT、pYC2/NT、pDR196、p416GDP、pESC-URA等质粒。酿酒酵母含有大量严格控制的具有不同特征的己糖转运蛋白,这些己糖转运蛋白有转运葡萄糖的潜力,大部分酵母中含有17个己糖转运蛋白(Hexose transporter)HXT1-HXT17,CEN.PK2-1C只含有16个己糖转运蛋白(Hexose transporter)HXT1-HXT16;GAL2:半乳糖渗透酶基因,为半乳糖利用所必须,同时具有运输葡萄糖的功能;还有三个麦芽糖转运蛋白家族成员(Agt1、Ydl247、Yjr160)能够运输己糖;此外,STL1(Sugar Transporter-Like protein)为质膜甘油质子同向转运体,也被认为参与到葡萄糖的转运代谢过程中。为了消除CEN.PK2-1C酵母对葡萄糖的摄取能力,利用Cre/LoxP系统将HXT1-HXT16、GAL2、AGT1、YDL247w和YJR160c这些能够运输己糖的基因,加上STL1共21个基因全部删除,即是EBY.VW4000。EBY.VW4000作为己糖转运蛋白缺陷酵母菌株,其葡萄糖的吸收和转运活性被完全消除,其他己糖的吸收和转运能力也被消除,是发现和研究天然或异源(其他物种)己糖转运蛋白的高效试验平台。EBY.VW4000不能同化葡萄糖或其他己糖作为碳源,在含有2%麦芽糖的培养基中生长正常。

     pDR196是酿酒酵母蛋白高效表达载体,筛选标记为Ura3。将己糖转运蛋白编码的基因X构建到pDR196 载体中(pDR196-X),将其转化EBY.VW4000感受态细胞,蛋白就会促进酵母吸收利用培养基中的己糖,进而使得EBY.VW4000酵母菌能够在只含己糖培养基中正常生长。

品规格


产品名称
产品货号
产品价格
说明书下载
EBY.VW4000酵母己糖转运活性检测试剂盒
YCK7140 3880


品内容


组分类别
组分名称
规格
货号 储存温度
培养基
SM/-Ura with Agar(含麦芽糖)
55 g×1瓶
YM5104S-2L
RT
SD/-Ura with Agar(含葡萄糖)
0.5 L×1袋
YM3104S
RT
SF/-Ura with Agar(含果糖)
55 g×1瓶
YM6104S-2L
RT
SM/-Ura Broth(含麦芽糖) 15 g×1瓶 YM5104L-2L
RT
质粒 pDR196质粒 50 µL×1支 PS2011
-20℃
pDR196-AtSWEET4质粒 50 µL×1支 PS2012
-20℃
酵母感受态 EBY.VW4000 Chemically Competent Cell 100 µL×20支


YC1140


-80℃
pYES2 (control vector, 10 ng/μl) 10 µL×1支 -20℃
Carrier DNA (10 μg/μl) 100 µL×2支 -20℃
PEG/LiAC 5 mL×2支 4℃
说明书 / 1份 /
/



品特点


     本试剂盒可用于检测蛋白是否具有己糖转运活性,简单高效。包含了己糖转运活性检测所需的全部试剂、菌株和载体。


操作步骤


一、培养基配制(试剂盒中的培养基为预混培养基,PH值固定为5.8±0.1,不用实验者调ph值)

     SM/-Ura液体培养基:取SM/-Ura Broth培养基3.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后补加20%麦芽糖溶液50 mL,温度降到30℃以下使用。

     SD/-Ura with Agar固体培养基:取SD/-Ura with Agar培养基一袋,加蒸馏水450 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.5 L,121℃-15min灭菌,温度降到55度以下倒平板即可。

     SM/-Ura固体培养基:取SM/-Ura Broth培养基13.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后加20%麦芽糖溶液50 mL,温度降到55℃以下倒平板即可。

     SF/-Ura固体培养基:取SF/-Ura Broth培养基13.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后补加20%果糖溶液50 mL,温度降到55℃以下倒平板即可。


二、实验方法

  1. 载体构建

     将目的基因X的CDS构建到pDR196载体中,即为实验组pDR196-X。pDR196载体信息参考本公司官网。

  2. 酵母转化

(1)Carrier DNA的预处理:将Carrier DNA插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

(2)取100 µL冰上融化的EBY.VW4000感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-5 µg,预处理后的Carrier DNA 10 µL,PEG/LiAc 500 µL并吸打几次混匀,30℃水浴30 min (15 min时翻转6-8次混匀)。

(3)将管放42℃水浴15 min(7.5 min时翻转6-8次混匀)。

(4)5000 rpm离心40 s弃上清,ddH2O 400 µL重悬,离心30s弃上清。

(5)ddH2O 50 µL重悬,涂板(筛选平板可根据转化质粒的筛选标记选择),29℃培养48-96 h。

按表2将各个质粒分别转入酵母EBY.VW4000感受态细胞。

表2 酵母转化质粒

 
 培养基
 pDR196
 SM/-Ura with Agar
 pDR196-AtSWEET4
 同上
 pDR196-X
 同上

  3. 阳性克隆鉴定(选做)

     此步骤可选做,也可忽略不做,鉴定引物可使用M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT和T7 R:CCTATAGTGAGTCGTATTA,实际扩增条带大小为383 bp。

  4. 己糖转运活性检测

(1)在每个平板中挑取新鲜单菌落,用SM/-Ura Broth(含麦芽糖)液体培养基过夜培养,OD600为1-2之间。

(2)6000g 离心1 min,弃上清。用灭菌ddH2O洗涤三次,并稀释至OD600为0.5。

(3)用ddH2O依次稀释10倍,100倍,1000倍,10000倍(即OD600=0.5,0.05,0.005,0.0005,0.00005)。

(4)按照先后顺序,分别取5 μL在含不同糖的平板(SM/-Ura、SD/-Ura、SF/-Ura)上点板。

(5)28-30℃培养2-5 d,观察每个样品在不同筛选平板上的生长状况,确定目标蛋白是否具有糖转运活性。

注意:应挑中等大小的菌落,不要挑过大或过小的菌落,不同菌落得到的结果会有差异,所以对选中的菌落应做好标记或保种,以备下次使用;平板要事先倒好,打开盖子在超净台吹1小时后点板,每个位置点5ul,不可点样过多,菌液过多或平板不干会导致菌液不易干,相邻位置的菌液扩散后容易连成片或菌液扩散形状不规则,一般点样后2分钟内干燥为宜。

  5. 示例结果分析

     将阳性对照(pDR196-SWEET4)、阴性对照(pDR196)载体分别转化 EBY.VW4000 感受态细胞。EBY.VW4000(pDR196-SWEET4)、EBY.VW4000(pDR196)在 SM/-Ura(含麦芽糖)培养基均能够正常生长;在 SD/-Ura(含葡萄糖)培养基、SF/-Ura(含果糖)培养基中,EBY.VW4000(pDR196-SWEET4)可以正常生长,而EBY.VW4000(pDR196)的生长受到抑制,因为SWEET4具有己糖转运活性,SWEET4的表达促进了酵母吸收、利用葡萄糖和果糖(如图1)。


图1 AtSWEET4己糖转运活性检测(本公司验证结果)


  6. 若没有观察到预期表型,可能原因分析如下:

(1)目标基因无相关功能;

(2)目标基因功能较弱,需要优化糖浓度,或其他试验条件;

(3)目标基因无表达,或表达量弱,可western blot检测目标基因是否表达,若没有表达,需要重新优化密码子构建酵母表达质粒。


注意事项


1. 点板之前,阴性对照、阳性对照,试验组的OD值要调一致;起始OD600值一般为0.5,根据实验结果也可以调整为0.05-1.0之间,但阴性对照、阳性对照与试验组的OD值一定要调一致。

2. 稀释倍数可根据实验调整,可按10倍稀释也可按5倍稀释,设置3-5个梯度均可。


参考文献


[1]Xiaozhu L ,Yan Z ,Chao Y , et al. AtSWEET4, a hexose facilitator, mediates sugar transport to axial sinks and affects plant development. [J]. Scientific reports, 2016, 6 (1): 24563.

[2]Daniel S ,Marcel B D V ,A G N K , et al. The genome sequence of the popular hexose-transport-deficient Saccharomyces cerevisiae strain EBY.VW4000 reveals LoxP/Cre-induced translocations and gene loss. [J]. FEMS yeast research, 2015, 15 (2):

[3]Li-Qing C ,Bi-Huei H ,Sylvie L , et al. Sugar transporters for intercellular exchange and nutrition of pathogens. [J]. Nature, 2010, 468 (7323): 527-32.

品规格


产品名称
产品货号
产品价格
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EBY.VW4000酵母己糖转运活性检测试剂盒
YCK7140 3880


品内容


组分类别
组分名称
规格
货号 储存温度
培养基
SM/-Ura with Agar(含麦芽糖)
55 g×1瓶
YM5104S-2L
RT
SD/-Ura with Agar(含葡萄糖)
0.5 L×1袋
YM3104S
RT
SF/-Ura with Agar(含果糖)
55 g×1瓶
YM6104S-2L
RT
SM/-Ura Broth(含麦芽糖) 15 g×1瓶 YM5104L-2L
RT
质粒 pDR196质粒 50 µL×1支 PS2011
-20℃
pDR196-AtSWEET4质粒 50 µL×1支 PS2012
-20℃
酵母感受态 EBY.VW4000 Chemically Competent Cell 100 µL×20支


YC1140


-80℃
pYES2 (control vector, 10 ng/μl) 10 µL×1支 -20℃
Carrier DNA (10 μg/μl) 100 µL×2支 -20℃
PEG/LiAC 5 mL×2支 4℃
说明书 / 1份 /
/



品特点


     本试剂盒可用于检测蛋白是否具有己糖转运活性,简单高效。包含了己糖转运活性检测所需的全部试剂、菌株和载体。


操作步骤


一、培养基配制(试剂盒中的培养基为预混培养基,PH值固定为5.8±0.1,不用实验者调ph值)

     SM/-Ura液体培养基:取SM/-Ura Broth培养基3.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后补加20%麦芽糖溶液50 mL,温度降到30℃以下使用。

     SD/-Ura with Agar固体培养基:取SD/-Ura with Agar培养基一袋,加蒸馏水450 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.5 L,121℃-15min灭菌,温度降到55度以下倒平板即可。

     SM/-Ura固体培养基:取SM/-Ura Broth培养基13.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后加20%麦芽糖溶液50 mL,温度降到55℃以下倒平板即可。

     SF/-Ura固体培养基:取SF/-Ura Broth培养基13.75 g,加蒸馏水400 mL搅拌溶解后(Agar不溶),定容到0.45 L,121℃-15min高压灭菌,灭菌后补加20%果糖溶液50 mL,温度降到55℃以下倒平板即可。


二、实验方法

  1. 载体构建

     将目的基因X的CDS构建到pDR196载体中,即为实验组pDR196-X。pDR196载体信息参考本公司官网。

  2. 酵母转化

(1)Carrier DNA的预处理:将Carrier DNA插入95℃金属浴5 min或插入浮漂中95℃水浴3 min,加热后快速插入冰中。

(2)取100 µL冰上融化的EBY.VW4000感受态细胞,依次加入预冷的目的质粒2-5 µg,预处理后的Carrier DNA 10 µL,PEG/LiAc 500 µL并吸打几次混匀,30℃水浴30 min (15 min时翻转6-8次混匀)。

(3)将管放42℃水浴15 min(7.5 min时翻转6-8次混匀)。

(4)5000 rpm离心40 s弃上清,ddH2O 400 µL重悬,离心30s弃上清。

(5)ddH2O 50 µL重悬,涂板(筛选平板可根据转化质粒的筛选标记选择),29℃培养48-96 h。

按表2将各个质粒分别转入酵母EBY.VW4000感受态细胞。

表2 酵母转化质粒

 
 培养基
 pDR196
 SM/-Ura with Agar
 pDR196-AtSWEET4
 同上
 pDR196-X
 同上

  3. 阳性克隆鉴定(选做)

     此步骤可选做,也可忽略不做,鉴定引物可使用M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT和T7 R:CCTATAGTGAGTCGTATTA,实际扩增条带大小为383 bp。

  4. 己糖转运活性检测

(1)在每个平板中挑取新鲜单菌落,用SM/-Ura Broth(含麦芽糖)液体培养基过夜培养,OD600为1-2之间。

(2)6000g 离心1 min,弃上清。用灭菌ddH2O洗涤三次,并稀释至OD600为0.5。

(3)用ddH2O依次稀释10倍,100倍,1000倍,10000倍(即OD600=0.5,0.05,0.005,0.0005,0.00005)。

(4)按照先后顺序,分别取5 μL在含不同糖的平板(SM/-Ura、SD/-Ura、SF/-Ura)上点板。

(5)28-30℃培养2-5 d,观察每个样品在不同筛选平板上的生长状况,确定目标蛋白是否具有糖转运活性。

注意:应挑中等大小的菌落,不要挑过大或过小的菌落,不同菌落得到的结果会有差异,所以对选中的菌落应做好标记或保种,以备下次使用;平板要事先倒好,打开盖子在超净台吹1小时后点板,每个位置点5ul,不可点样过多,菌液过多或平板不干会导致菌液不易干,相邻位置的菌液扩散后容易连成片或菌液扩散形状不规则,一般点样后2分钟内干燥为宜。

  5. 示例结果分析

     将阳性对照(pDR196-SWEET4)、阴性对照(pDR196)载体分别转化 EBY.VW4000 感受态细胞。EBY.VW4000(pDR196-SWEET4)、EBY.VW4000(pDR196)在 SM/-Ura(含麦芽糖)培养基均能够正常生长;在 SD/-Ura(含葡萄糖)培养基、SF/-Ura(含果糖)培养基中,EBY.VW4000(pDR196-SWEET4)可以正常生长,而EBY.VW4000(pDR196)的生长受到抑制,因为SWEET4具有己糖转运活性,SWEET4的表达促进了酵母吸收、利用葡萄糖和果糖(如图1)。


图1 AtSWEET4己糖转运活性检测(本公司验证结果)


  6. 若没有观察到预期表型,可能原因分析如下:

(1)目标基因无相关功能;

(2)目标基因功能较弱,需要优化糖浓度,或其他试验条件;

(3)目标基因无表达,或表达量弱,可western blot检测目标基因是否表达,若没有表达,需要重新优化密码子构建酵母表达质粒。


注意事项


1. 点板之前,阴性对照、阳性对照,试验组的OD值要调一致;起始OD600值一般为0.5,根据实验结果也可以调整为0.05-1.0之间,但阴性对照、阳性对照与试验组的OD值一定要调一致。

2. 稀释倍数可根据实验调整,可按10倍稀释也可按5倍稀释,设置3-5个梯度均可。


参考文献


[1]Xiaozhu L ,Yan Z ,Chao Y , et al. AtSWEET4, a hexose facilitator, mediates sugar transport to axial sinks and affects plant development. [J]. Scientific reports, 2016, 6 (1): 24563.

[2]Daniel S ,Marcel B D V ,A G N K , et al. The genome sequence of the popular hexose-transport-deficient Saccharomyces cerevisiae strain EBY.VW4000 reveals LoxP/Cre-induced translocations and gene loss. [J]. FEMS yeast research, 2015, 15 (2):

[3]Li-Qing C ,Bi-Huei H ,Sylvie L , et al. Sugar transporters for intercellular exchange and nutrition of pathogens. [J]. Nature, 2010, 468 (7323): 527-32.